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KSL003 Markdown for (Bio)Scientists

Write in Word, Save in Markdown, Publish in LaTeX.

Markdown is an easy-to-learn text formatting syntax that is mostly used for writing and publishing web content. It has become useful for scientists as well and this presentation gives an an overview of use-cases and tools which enable the writing of lab notes, academic manuscripts and even theses in Markdown. Held by Katrin Leinweber at the KoRS-CB retreat 2015.

Notes and links

Questions & answers

  • Beauty of rendered Markdown documents? Depends on the implementation and/or CSS renderer you chose! Most Markdown editors include a few basic ones that use modern web typography. With Scientific Markdown you get the full beauty of LaTeX typesetting.
  • Learning LaTeX still useful? LaTeX itself is useful, but the learning curve is steeper than Markdown.
  • Usefulness for manuscript submissions? Apparently no dedicated Markdown support yet, except for Authorea. But so many fields are jumping on the Markdown train, that publishers will hopefully accept it soon.

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KSL002 Digital Lab Journalling with Git

How you can use the version control software Git for scientific projects and for preparing manuscripts. See also this repository.

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Notes and References

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KNS022 – Ameise-Pilz-Problem

Diese Folge ist total biologisch. Irgendwie finden wir dieses Feld ziemlich spannend, und das spiegelt sich in der Selektion von Themen wieder. Deshalb haben wir das wohl studiert (Aber auch Chemie!). Wie soll man aber auch der Entschlüsselung von Genomknäueln widerstehen? Oder der Nutzung von niedrigenergetischen Lasern, um die körpereigene Regeneration von Zähnen anzuregen, die vielleicht in Zukunft die dem Menschen ureigenste Angst vor Zahnärzten nehmen kann. Darüber hinaus sprechen Katrin und Mariëlle über Landwirtschaft jenseits des Menschen und über die steigende Rate der Entdeckung neuer Haiarten - bei gleichzeitiger Abnahme der Populationen. Dazu kommt noch ein Nachtrag zur Scientific Writing Software sowie eine laaange Liste von Empfehlungen, teilweise aus (so gut wie fast noch) nie zuvor empfohlenen Kategorien. Viel Spaß beim Hören!

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Sendungsnotizen


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