KNS031 special: sciNote

In order to bridge the PhD-finishing-job-starting-induced shortage of regular, German episodes with the classical KonScience team, Katrin interviewed Dr. Jana Erjavec about sciNote. It's an electronic laboratory notebook produced by BioSistemika as a free & open source software. We recorded the interview at the Paperless Lab Academy 2016 in Barcelona. PS: The sound quality may not be optimal, due to minimal mobile recording equipment and Barcellona's nearby airport. Sorry about that!

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Links & Notes

KNS030 Betreutes Überleben

KonScience wird 30 Folgen alt/lang/breit! Zum Herbstanfang wenden wir uns einigen interessanten Symbiosen von Zwergtintenfischen um Hawaii zu, sowie einer Bedrohung für die Genauigkeit von Kohlenstoff-14-Datierungen, den Gründen für die ungewöhnlich schnelle Artbildung bei den Orchidee, und der Möglichkeit, dass Menschen landwirtschaftliche Versuchsfelder schon kurz nach dem Maximum der letzten Eiszeit und damit lange vor der agrarischen Revolution in Mesopotamien angelegt haben könnten. Außerdem gibt es natürlich die Auflösung des CRISPR-Cliffhangers aus Folge 29. Man kann Genomeditierung nämlich auch für die Wiederbelebung ausgestorbener Arten verwenden. Aber sollte man? Und wenn ja, wie viele?

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KSL003 Markdown for (Bio)Scientists

Write in Word, Save in Markdown, Publish in LaTeX.

Markdown is an easy-to-learn text formatting syntax that is mostly used for writing and publishing web content. It has become useful for scientists as well and this presentation gives an an overview of use-cases and tools which enable the writing of lab notes, academic manuscripts and even theses in Markdown. Held by Katrin Leinweber at the KoRS-CB retreat 2015.

Notes and links

Questions & answers

  • Beauty of rendered Markdown documents? Depends on the implementation and/or CSS renderer you chose! Most Markdown editors include a few basic ones that use modern web typography. With Scientific Markdown you get the full beauty of LaTeX typesetting.
  • Learning LaTeX still useful? LaTeX itself is useful, but the learning curve is steeper than Markdown.
  • Usefulness for manuscript submissions? Apparently no dedicated Markdown support yet, except for Authorea. But so many fields are jumping on the Markdown train, that publishers will hopefully accept it soon.

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